###本プロジェクトの目的: scipy,numpyに代表される豊富な科学技術計算向けオープンソースライブラリを持つPythonを、DPI-C経由でRTL検証環境から叩くことにより、Pythonで記述されたアナログ回路や物理モデルとRTLで記述されたデジタル回路を並行して ...

ゲノム解析の練習やツール検証のときに「仮想的な Illumina リード」を使いたい場面は多いと思います。そこで今回は、任意の FASTAファイルから Illumina 形式のペアエンドFASTQ を生成できる Python スクリプトを公開します。

実行後resultsディレクトリ内に結果をまとめたpickleファイルが作成されます。 初期の設定では計算に時間がかかる可能性があるので、テスト実行の際はsimulation.py内の最大時間(選択数)t_max、試行回数ave_maxを小さめに設定して実行することをおすすめします。

プログラマー育成を支援するInitial Commitが、ローカルリポジトリにおけるGitの動作をシミュレート可能なコマンドラインツール「git-sim」を2023年1月22日にリリースしました。git-simを使うことで、Gitコマンドがリポジトリに及ぼす影響を視覚化した画像や ...